SNP基因分型技术是一种常用的SNP检测方法，它可以快速、准确地检测SNP位点的基因型。 SNP基因分型技术的原理主要包括PCR扩增、限制性内切酶切割和凝胶电泳等步骤。

基因位点可以是单个碱基（如SNP，即单核苷酸多态性），也可以是一个基因的整个区域。 基因座 是一个更广泛的概念，通常指在某个特定物种的基因组中，有多个位点（locus）同时存在， …

最显著的SNP指的是P值最小的点，在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点，后来会进一步用conditional 分 …

Jul 2, 2024 · SNP下游分析 | 利用VCF文件进行构建系统进化树 在之前的一篇推文中，我们学会了如何使用GATK软件对测序数据（基因组测序和转录组测序均可）进行变异分析（SNP …

eQTL和SNP都与基因的遗传变异有关，二者都可以反映遗传基因型与表现型之间的关系。 可以说，eQTL实际上是对SNP影响基因表达的一种描述。

SNP分析最直接的能能到的信息是，群体内，不同个体间的碱基的变化信息，那通过这些我们能做哪些应用呢？ 个体识别和亲缘关系鉴定: 个体识别这个在刑侦中应该大家还听得挺多的，通过 …

芯片和测序是两种不同的检测平台。实验的原理也是不同的，通常说的染色体芯片分析 (chromosomal microarray analysis, CMA) =aCGH+SNParray两种技术的组合，Array-based …

Jun 28, 2014 · 手机答题，所以先简单说说吧。 多态性主要认为是SNP和INDEL。对于个体而言任何位置都是有可能出现的，原因也千差万别，因为病毒，突变， 测序 造成的等等。。如果说 …

在单核苷酸多态性（SNP）数据库中，REF（Reference）通常表示参考序列中的碱基，即在大多数人群中被认为是“正常”或“野生型”的等位基因。ALT（Alternate）则表示与REF不同的等位基 …

如果给定 (即模式1)，则从输入snp中取出REF和ALT等位基因，否则选择REF数量最高的碱基，ALT数量次之 (模式2)。 当给定snp (模式1)时，cellsnp-lite将通过将输入snp按顺序等分入多 …